Evaluation of completeness and timeliness of data in the National Information System for Notifiable Diseases for spotted fever in the state of São Paulo, Brazil, 2007-2017.

OBJECTIVE: to evaluate the completeness and timeliness of notifications of cases of spotted fever (SF) held on the Notifiable Health Conditions Information System (SINAN) in São Paulo State, Brazil, from 2007 to 2017. METHODS: this was a descriptive and ecological study of confirmed human cases of SF regarding completeness and timeliness of ten fields of the notification form (good if ≥ 90% for most variables); time series analysis was performed using the Prais-Winsten technique. RESULTS: we analyzed 736 records; among essential fields, only "Discharge date" showed poor completeness (68.5%). Timeliness was good for the "Investigation" and "Closure" fields; other time lapses were not adequate. CONCLUSION: in São Paulo state, data completeness was good for most variables, whereas timeliness was not adequate (except for "Closure" and "Investigation"), pointing to the need for health education and communication actions about SF.

Evaluation of completeness and timeliness of data in the National Information System for Notifiable Diseases for spotted fever in the state of São Paulo, Brazil, 2007-2017 / Evaluación de la integridad and oportunidad de datos en el Sistema de Información sobre Enfermedades de Notificación Obligatoria por fiebre manchada en el estado de São Paulo, Brasil, 2007-2017 / Avaliação da completitude e oportunidade dos dados no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan) para febre maculosa no estado de São Paulo, 2007-2017

Objective: To evaluate the completeness and timeliness of notifications of cases of spotted fever (SF) in the National System of Information on Notifiable Diseases (Sinan) in the state of São Paulo, from 2007 to 2017. Methods: This is a descriptive and ecological study of confirmed human cases of SF for completeness and timeliness of ten form fields (good if ≥ 90% for most variables). Linear regression was performed to analyze trends in the time series. Results: Among essential fields, only "Discharge date" showed low completeness (68.5%). "Investigation" and "Closure" had good timeliness; other intervals were not adequate. Conclusion: In the state of São Paulo, data completeness was good for most variables, but not adequate in terms of timeliness, except for "Closing" and "Investigation", pointing to the need for health education and communication actions on SF.

Objetivo: Evaluar la integridad y oportunidad de las notificaciones de casos de fiebre maculosa (SF) en el Sistema Nacional de Información sobre Enfermedades de Declaración Obligatoria (Sinan) en el estado de São Paulo, de 2007 a 2017. Métodos: Se trata de un estudio descriptivo y ecológico. estudio de casos humanos confirmados de SF para la integridad y puntualidad de diez campos de formulario (bueno si ≥ 90% para la mayoría de las variables). Se realizó una regresión lineal para analizar las tendencias en la serie temporal. Resultados: Entre los campos esenciales, solo "Fecha de alta" mostró baja completitud (68,5%). "Investigación" y "Cierre" tuvieron buena oportunidad; otros intervalos no fueron adecuados. Conclusión: En São Paulo, la completitud fue buena para la mayoría de las variables, pero no adecuada en cuanto a la oportunidad, excepto para "Cierre" e "Investigación", lo que apunta a la necesidad de acciones de educación y comunicación en salud sobre SF.

Objetivo: avaliar completitude e oportunidade das notificações de casos de febre maculosa (FM) no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan), no estado de São Paulo, Brasil, no período de 2007 a 2017. Métodos: estudo descritivo e ecológico dos casos humanos confirmados de FM, mediante análise dos atributos "completitude" e "oportunidade" de dez campos da ficha de notificação (boas quando ≥ 90% para a maioria das variáveis); realizou-se análise de regressão linear para avaliar as tendências das séries temporais. Resultados: foram analisados 736 registros; dos campos essenciais, apenas "Data da alta" demonstrou baixa completitude (68,5%); "Investigação" e "Encerramento" tiveram boa oportunidade; demais intervalos não foram adequados. Conclusão: no estado de São Paulo, a completitude dos dados foi boa na maioria das variáveis, porém não adequada quanto à oportunidade (exceto para "Encerramento" e "Investigação"), apontando para a necessidade de ações de educação e comunicação em saúde sobre FM.

Avaliação da completitude e oportunidade dos dados no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan) para febre maculosa no estado de São Paulo, 2007-2017 / Evaluación de la completitud y oportunidad de datos en el Sistema de Información sobre Enfermedades de Notificación Obligatoria (Sinan) por fiebre manchada en el estado de São Paulo, Brasil, 2007-2017 / Evaluation of completeness and timeliness of data in the National Information System for Notifiable Diseases for spotted fever in the state of São Paulo, Brazil, 2007-2017

Objective: to evaluate the completeness and timeliness of notifications of cases of spotted fever (SF) held on the Notifiable Health Conditions Information System (SINAN) in São Paulo State, Brazil, from 2007 to 2017. Methods: this was a descriptive and ecological study of confirmed human cases of SF regarding completeness and timeliness of ten fields of the notification form (good if ≥ 90% for most variables); time series analysis was performed using the Prais-Winsten technique. Results: we analyzed 736 records; among essential fields, only "Discharge date" showed poor completeness (68.5%). Timeliness was good for the "Investigation" and "Closure" fields; other time lapses were not adequate. Conclusion: in São Paulo state, data completeness was good for most variables, whereas timeliness was not adequate (except for "Closure" and "Investigation"), pointing to the need for health education and communication actions about SF.

Objetivo: evaluar la completitud y oportunidad de las notificaciones de casos de fiebre manchada (FM) en el Sistema Nacional de Información sobre Enfermedades de Declaración Obligatoria (Sinan) en el estado de São Paulo, Brasil, de 2007 a 2017. Métodos: estudio descriptivo y ecológico de casos humanos confirmados de FM para completitud y oportunidad de diez campos del formulario (bueno si ≥ 90% para la mayoría de las variables). Se realizó una regresión lineal para analizar las tendencias de las series temporales. Resultados: entre los campos esenciales, solo "Fecha de alta" mostró baja completitud (68,5%). "Investigación" y "Cierre" tuvieron buena oportunidad; otros intervalos no fueron adecuados. Conclusión: en São Paulo, la completitud fue buena para la mayoría de las variables, pero no adecuada en cuanto a la oportunidad, excepto para "Cierre" e "Investigación", lo que apunta a la necesidad de acciones de educación y comunicación en salud sobre FM.

Objetivo: avaliar completitude e oportunidade das notificações de casos de febre maculosa (FM) no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (Sinan), no estado de São Paulo, no período de 2007 a 2017. Métodos: estudo descritivo e ecológico dos casos humanos confirmados de FM, mediante análise dos atributos completitude e oportunidade de dez campos da ficha de notificação (boas quando ≥ 90% para a maioria das variáveis); na análise das tendências das séries temporais, utilizou-se a técnica de Prais-Winsten. Resultados: foram analisados 736 registros; dos campos essenciais, apenas "Data da alta" demonstrou baixa completitude (68,5%); "Investigação" e "Encerramento" tiveram boa oportunidade; demais intervalos não foram adequados. Conclusão: no estado de São Paulo, a completitude dos dados foi boa na maioria das variáveis, porém não adequada quanto à oportunidade (exceto para "Encerramento" e "Investigação"), apontando para a necessidade de ações de educação e comunicação em saúde sobre FM.

Análise crítica e descritiva do sistema de informação e têmporo-espacial de casos humanos de febre maculosa no estado de São Paulo entre os anos de 2007 e 2017 / Critical and descriptive analysis of the information systems and spatiotemporal analysis of human cases of spotted fever in São Paulo State between 2007 and 2017

OBJETIVOS: Avaliar completitude e oportunidade dos dados registrados no Sistema Nacional de Informação de Agravos de Notificação (SINAN) para os casos de febre maculosa (FM) no estado de São Paulo; Analisar as tendências das taxas de incidência e mortalidade por febre maculosa brasileira (FMB) com base na distribuição espacial de cada vetor; Investigar desfechos por locais de internação; Identificar quais as áreas de maior risco de ocorrência de FM, qual a sua distribuição por zona de ocupação humana e se este risco se manteve estável no território ao longo do período estudado; Projetar a provável evolução da ocorrência no tempo e no espaço. MÉTODOS: Esta tese está dividida em três manuscritos. Manuscrito 1: Trata-se de estudo descritivo e ecológico dos casos humanos confirmados de FM, notificados no SINAN de 2007 a 2017 no estado de São Paulo analisando atributos completitude e oportunidade de dez campos da ficha de notificação. Realizou-se regressão linear para avaliar as tendências das séries temporais (p<0,05). Manuscrito 2: Estudo de série temporal utilizando dados secundários de casos humanos confirmados de FMB por carrapato-vetor no estado de São Paulo, utilizando o software Joinpoint. Os dados foram georreferenciados pelos locais de internação. Manuscrito 3: Trata-se de estudo ecológico de varredura espaço-temporal de casos humanos confirmados notificados de FM com análise do risco de ocorrência da doença no local provável de infecção (LPI), por meio do SaTScan. RESULTADOS: Manuscrito 1: Foram analisados 736 registros. Dos campos essenciais, apenas Data da alta demonstrou baixa completitude (68,5%). Investigação e Encerramento tiveram boa oportunidade; demais intervalos não foram adequados. Manuscrito 2: Nas áreas de Amblyomma sculptum, houve tendência de aumento da incidência e mortalidade (ambos p<0,05), entre 2007 e 2015. Nas áreas de Amblyomma aureolatum, houve tendência de redução da incidência (p<0,05), enquanto a tendência de mortalidade permaneceu estável em todo o período estudado. A letalidade nos casos relacionados ao A. aureolatum foi maior do que nos casos de A. sculptum (67,1% contra 55,0%, p=0,037). A maioria dos pacientes foi hospitalizada próximo ao LPI. Manuscrito 3: No presente momento, comportamento predominantemente urbano para A. sculptum, A. aureolatum e Amblyomma ovale foi verificado, explicado pela atual expansão imobiliária e pelo maior contato de cães domésticos com áreas de floresta. Duas novas áreas potenciais de ocorrência da FM associadas a A. sculptum foram identificadas no período analisado; enquanto para A. aureolatum não houve nova área endêmica. CONCLUSÕES: No estado de São Paulo, a completitude dos dados de FM foi boa (80,0%) na maioria das variáveis estudadas, mas a oportunidade estudada não. Isso aponta para a importância de ações de educação e comunicação em saúde sobre FM. As curvas de incidência e mortalidade foram marcadamente diferentes de acordo com o carrapato-vetor, apontando para uma pior taxa de letalidade quando A. aureolatum foi implicado. Esses achados podem orientar ações específicas de vigilância e abordagens assistenciais, considerando os diferentes territórios. O delineamento ecológico com análise espaço-temporal permitiu melhor detecção de aglomerados de alto risco de distribuição da FM em humanos no espaço e no tempo, contribuindo para a estruturação de ações em saúde coletiva específicas para as diferentes áreas do estado.

AIM: To evaluate completeness and timeliness of data registered in the National Information System for Notifiable Diseases (SINAN) for spotted fever (SF) cases in the state of São Paulo; To analyze the trends of incidence and mortality rates caused by Brazilian spotted fever (BSF) based on each vector spatial distribution; To investigate outcomes by hospitalization sites; Identify which areas are most at risk for the occurrence of SF, their distribution by human occupation zone and whether this risk has remained stable in the territory throughout the period studied; Project the probable evolution of the occurrence in time and space. METHODS: This thesis is divided into three manuscripts. Manuscript 1: This is a descriptive and ecological study of confirmed human cases of SF, reported in Sinan from 2007 to 2017 in the state of São Paulo for completeness and timeliness of ten form fields. Linear regression was performed to analyze trends in the time series (p<0.05). Manuscript 2: A time-series study using secondary data of BSF confirmed human cases by tick-vector in the state of São Paulo, using Joinpoint software. Data was georeferenced by hospitalization sites. Manuscript 3: This was an ecological spatiotemporal clustering study of SF confirmed human cases. The risk analysis of disease occurrence by probable site of infection (PSI) was performed through SaTScan. RESULTS: Manuscript 1: A total of 736 registration were analyzed. Among essential fields, only Discharge date showed low completeness (68.5%). Investigation and Closure had good timeliness; other intervals were not adequate. Manuscript 2: In Amblyomma sculptum areas, there were upward incidence and mortality trends (both p<0.05), between 2007 and 2015. In Amblyomma aureolatum areas, there was a downward incidence trend (p<0.05), while the mortality trend remained stable through all studied period. Lethality rate in A. aureolatum related cases was higher than A. sculptum ones (67.1% against 55.0%, p=0.037). The majority of the patients were hospitalized near PSI. Manuscript 3: Currently, it was verified a predominantly urban behavior for A. sculptum, A. aureolatum, and Amblyomma ovale, which can be explained by the existing real estate expansion and by a higher exposure of pet dogs to forest areas. Two new areas with potential A. sculptum-related SF occurrence were identified, while there were no new endemic territories for A. aureolatum. CONCLUSIONS: In São Paulo, the completeness of SF data was good in most of the variables studied (80,0%), but not timeliness, highlighting the importance of education on SF. Incidence and mortality curves were markedly different according to tick-vector, pointing to a worse lethality rate when A. aureolatum was implicated. These findings may orient specific surveillance actions and assistance approaches, considering the different territories. This approach enabled a better quantification of high-risk spatiotemporal clusters of human SF, contributing for the tailoring of specific public health actions towards different state regions.

Molecular detection of Anaplasmataceae agents in Dasyprocta azarae in northeastern Brazil.

Recently, the importance of wild-living rodents for maintenance of pathogens of the family Anaplasmataceae in the environment was investigated. These mammals play a role as reservoirs for these pathogens and act as hosts for the immature stages of tick vectors. The aim of the present study was to investigate the prevalence of Ehrlichia sp. and Anaplasma sp. in 24 specimens of Azara's agouti (Dasyprocta azarae) that had been trapped in the Itapiracó Environmental Reserve, in São Luís, Maranhão, northeastern Brazil, using molecular methods. Four animals (16.7%) were positive for Ehrlichia spp. in nested PCR assays based on the 16S rRNA gene. In a phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene, using the maximum likelihood method and the GTRGAMMA+I evolutionary model, Ehrlichia sp. genotypes detected in Azara's agoutis were found to be closely related to E. canis and to genotypes relating to E. canis that had previously been detected in free-living animals in Brazil. The present work showed the first molecular detection of Ehrlichia sp. in Azara's agoutis in Brazil.

Molecular detection of Anaplasmataceae agents in Dasyprocta azarae in northeastern Brazil / Detecção molecular de agentes Anaplasmataceae em Dasyprocta azarae no nordeste do Brasil

Abstract Recently, the importance of wild-living rodents for maintenance of pathogens of the family Anaplasmataceae in the environment was investigated. These mammals play a role as reservoirs for these pathogens and act as hosts for the immature stages of tick vectors. The aim of the present study was to investigate the prevalence of Ehrlichia sp. and Anaplasma sp. in 24 specimens of Azara's agouti (Dasyprocta azarae) that had been trapped in the Itapiracó Environmental Reserve, in São Luís, Maranhão, northeastern Brazil, using molecular methods. Four animals (16.7%) were positive for Ehrlichia spp. in nested PCR assays based on the 16S rRNA gene. In a phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene, using the maximum likelihood method and the GTRGAMMA+I evolutionary model, Ehrlichia sp. genotypes detected in Azara's agoutis were found to be closely related to E. canis and to genotypes relating to E. canis that had previously been detected in free-living animals in Brazil. The present work showed the first molecular detection of Ehrlichia sp. in Azara's agoutis in Brazil.

Resumo Recentemente, a importância de roedores selvagens na manutenção de agentes Anaplasmataceae no ambiente tem sido investigada, haja visto o papel que tais mamíferos podem desempenhar como reservatórios para os patógenos e como hospedeiros para estágios imaturos dos carrapatos vetores. O presente estudo objetivou investigar a ocorrência de Ehrlichia sp. e Anaplasma sp. em 24 cotias (Dasyprocta azarae) capturadas na Reserva Ambiental de Itapiracó, em São Luís, Maranhão, nordeste do Brazil, utilizando métodos moleculares. Quatro animais (16,7%) mostraram-se positivos nos ensaios de nested PCR para Ehrlichia spp. baseados no gene 16S rRNA gene. Na análise filogenética baseda no gene 16S rRNA e utilizando o método de Máxima Verossimilhança e modelo evolutivo GTRGAMMA+I, os genótipos de Ehrlichia sp. detectados em cotias mostraram-se filogeneticamente relacionados às sequências de E. canis e outros genótipos relacionados a E. canis detectados previamente em animais selvagens no Brasil. O presente trabalho mostrou a primeira detecção molecular de Ehrlichia sp. em cotias no Brasil.

Genetic diversity of piroplasmids species in equids from island of São Luís, northeastern Brazil.

Equine piroplasmosisis, a tick-borne disease caused by the intra-erythrocytic protozoans Babesia caballi and Theileria equi, has economic importance due to the international trade and the increased movement of horses all over the world. The goal of this study was to evaluate the occurrence of phylogenetic diversity of T. equi and B. caballi genotypes among infected equids from São Luís Island, state of Maranhão, northeastern Brazil. Between December of 2011 and June of 2012, EDTA-blood and serum samples were collected from 139 equids (90 donkeys, 39 horses and 10 mules). From 139 serum samples submitted to ELISA assay, IgG antibodies to T. equi and B. caballi were detected in 19.4% (27/139) and 25.2% (35/139), respectively. Among sampled animals, 21.6% (30/139) and 55.4% (77/139) were positive for cPCR assays for T. equi and B. caballi, based on ema-1 and rap-1 genes, respectively. Overall, the T. equi sequences (n=7) submitted to Maximum Likelihood analysis (based on a 18S rRNA fragment of 1700 bp after alignment) grouped into three main groups, which were subdivided in eight clusters. The present work showed that different genotypes of T. equi and B. caballi circulate among equids in Brazil.

Genetic diversity of piroplasmids species in equids from island of São Luís, northeastern Brazil / Diversidade genética de espécies de piroplasmídeos em equídeos na ilha de São Luís, Nordeste do Brasil

Abstract Equine piroplasmosisis, a tick-borne disease caused by the intra-erythrocytic protozoans Babesia caballi and Theileria equi, has economic importance due to the international trade and the increased movement of horses all over the world. The goal of this study was to evaluate the occurrence of phylogenetic diversity of T. equi and B. caballi genotypes among infected equids from São Luís Island, state of Maranhão, northeastern Brazil. Between December of 2011 and June of 2012, EDTA-blood and serum samples were collected from 139 equids (90 donkeys, 39 horses and 10 mules). From 139 serum samples submitted to ELISA assay, IgG antibodies to T. equi and B. caballi were detected in 19.4% (27/139) and 25.2% (35/139), respectively. Among sampled animals, 21.6% (30/139) and 55.4% (77/139) were positive for cPCR assays for T. equi and B. caballi, based on ema-1 and rap-1 genes, respectively. Overall, the T. equi sequences (n=7) submitted to Maximum Likelihood analysis (based on a 18S rRNA fragment of 1700 bp after alignment) grouped into three main groups, which were subdivided in eight clusters. The present work showed that different genotypes of T. equi and B. caballi circulate among equids in Brazil.

Resumo A piroplasmose equina, uma doença transmitida por carrapatos e causada pelos protozoários intra-eritrocíticos Babesia caballi e Theileria equi, tem importância econômica devido ao comércio internacional e ao aumento do movimento de cavalos em todo o mundo. O objetivo do presente estudo foi mostrar a diversidade filogenética de T. equi e B. caballi infectando cavalos, burros e jumentos na Ilha de São Luís, Estado do Maranhão, Nordeste do Brasil. Entre dezembro de 2011 e junho de 2012, amostras de sangue com EDTA e soro de foram coletadas de 139 equídeos (90 jumentos, 39 cavalos e 10 burros). Dentre as 139 amostras de soro submetidas ao ensaio de ELISA, foram detectados anticorpos IgG contra T. equi e B. caballi em 19,4% (27/139) e 25,2% (35/139), respectivamente. Entre os animais amostrados, 21,6% (30/139) e 55,4% (77/139) foram positivos por meio dos ensaios de cPCR para T. equi e B. caballi, com base nos genes ema-1 e rap-1, respectivamente. No geral, as sequências T. equi (n = 7) submetidas à análise de Máxima Verossimilhança (baseada em um fragmento do 18S rRNA de 1700 pb, após o alinhamento) foram agrupadas em três grupos principais, os quais foram subdivididos em oito grupos. O presente trabalho mostrou que diferentes genótipos de T. equi e B. caballi circulam entre equídeos no Brasil.

Alterações anatomopatológicas em rete ovarii de fêmeas bovinas mestiças / Anatomopathological changes in rete ovarii of mestizo cattle

O objetivo do presente estudo foi identificar e caracterizar as principais alterações patológicas em rete ovarii, observadas em rebanho bovino mestiço. Foram coletadas amostras de 467 pares de ovários de fêmeas bovinas (gestantes e não gestantes), com idades variáveis, provenientes de dois frigoríficos da região metropolitana de Belo Horizonte, Minas Gerais, Brasil, no período de setembro a dezembro de 2012, para avaliação anatomopatológica. Das amostras coletadas, observou-se a rete ovarii em ambos os lados de 417/467 animais (89,3%). Na análise macroscópica, verificou-se a presença de cistos foliculares (5,03%), cistos de corpo lúteo (0,72%) e secreções purulentas (0,48%) de coloração amarela intensa e consistência viscosa, indicativo de processo inflamatório supurativo. No exame microscópico, observaram-se em 23/417 amostras (5,51%), um processo hiperplásico adenomatoso de rete ovarii, com espessamento da camada epitelial, modificação do padrão de epitélio variando de cúbico a colunar, com duas ou três camadas de células, sendo em alguns momentos ciliadas e com dilatação tubular. Destas amostras, verificou-se associação de lesão hiperplásica com infiltrado inflamatório predominantemente linfomacrofágico em 15/23 amostras (65,22%). Ainda em relação às amostras confirmadas para hiperplasia, observou-se reação proliferativa estromal com característica fibroplástica em 21/23 amostras (91,30%). Conclui-se que em fêmeas bovinas mestiças a frequência de alterações encontradas em rete ovarii é baixa ou rara e o conhecimento desta lesão pode auxiliar no manejo reprodutivo desta espécie animal, a fim de diagnosticar possíveis alterações patológicas que podem promover subfertilidade e até infertilidade do rebanho bovino, que resultam em significativas perdas econômicas.

The aim of this study was to identify and characterize the main pathological changes in rete ovarii observed in cattle herd mestizo. Samples were collected from 467 pairs of ovaries of cows (pregnant and non-pregnant), with varying ages, from two refrigerators in the metropolitan region of Belo Horizonte, Minas Gerais, Brazil, in the period from September to December 2012 for anatomopathological evaluation. From samples collected, the rete ovarii was observed on both sides of 417/467 animals (89.3%). In macroscopic analysis, the presence of follicular cysts (5.03%), corpus luteum cyst (0.72%) and purulent discharge (0.48%) with yellow color and viscous consistency indicating a suppurative inflammatory process. At microscopic analysis, were observed in 23/417 samples (5.51%), a hyperplastic adenomatous rete ovarii process, and thickening of the epithelial cell layer, with two or three cell layers of cuboidal to columnar cells, and some cilia and tubular dilatation. From these samples, there was association between hyperplastic lesions with predominantly a lymphomacrofagic inflammatory cell infiltrate in 15/23 samples (65.22%). Also in relation to the samples confirmed for hyperplasia, there was proliferating fibroblasts in 21/23 samples (91.30%). It is concluded that in mestizo cattle the frequency of alterations found in rete ovarii is low or rarity, and the knowledge of this lesion may assist in the reproductive management of this animals species, in order to diagnose possible pathological alterations that can promote subfertility and even infertility of the herd that results in significant economic losses